延平郡王祠位于思明南路鸿山公园嘉兴阁南侧，紧邻嘉兴寨墙，用地996.238平方米，建筑占地336.03平方米，为闽南风格建筑，一落三间张双边护格局。根据鸿山公园的总体规划设计，此次祠堂选址正处规划的“延平遗风”中之西北侧区域，正可与嘉兴寨、太师太傅等郑氏遗存古迹有机结合，不仅完善了景区规划，也为更好地弘扬郑成功精神，加强郑成功文化交流提供一个很好的平台、环境。

　　延平郡王祠的地块周边顺应山势，地势西北侧略高，西南侧略低。祠堂正面西南，背靠东北，为营造庄严肃穆的氛围，利用场地前部山势高差设计了一个长阶，游客由地块东侧上山，行至此处，沿设计步道来到长阶前，拾级而上，便可到达祠堂前。

设计上，延平郡王祠采用传统闽南建筑风格，就连材料也选用了闽南特有的红色烟炙砖。延平郡王祠墙体为砖石墙，款式设计为传统镜面墙做法，由泉州白石和闽南特有的色彩艳丽的红色烟炙砖所砌。正房的两侧开间墙面特别设计为花砖组砌。山墙均采用闽南称“搁檩造”的山墙承重方式。屋面设计为传统闽南建筑中祠堂惯用的三川脊，正脊采用闽南古建筑所特有的燕尾脊，垂脊末端设有排头。正殿为悬山屋面，护厝为硬山屋面。屋面瓦采用闽南沿海地区常用的无釉红板瓦。

　　郑成功在厦遗迹很多，如鸿山公园上的嘉兴寨就曾为其屯兵处。郑成功祠堂在厦门仅此一处，但这种祠堂在台湾有58座。